使用超声波清洗机时，必须要先放入液体，倒入的液体要在槽体内具有一定的高度，以保证清洗机不能在空气状态下启动，以防毁坏设备。谨记禁止先启动设备后将液体倒入，这也是操作错误，会导致设备使用寿命缩短，有的直接毁坏设备。与此同时，倒入的液体的温度应当为常温。如果把高温液体直接倒入槽体内，可能会致使传感器松动或脱落，干扰清洗机使用效果。
超声波清洗机的正常运行必须有个卫生的作业环境，这样才会有益于清洗作业的顺利进行。例如当我们清洗有害物质时是在一个密闭的环境下进行作业，那样有害物质需要经过大家呼吸道进入身体，对人身健康造成危害。因此当我们购置超声波清洗机后，应将它置于干燥、通风、清洁的环境中。避开热源，防止放置于潮湿环境中。